カズヤは人類の敵「異次元体・ノヴァ」と戦うためゼネティックスへと編入し、そこで今は亡き姉と似た面影を持つ少女サテライザーと出会う。 幾多の闘いを越えて徐々に近づいていく二人。 3年生の謀略によって繰り広げられた激闘も、サテライザーの勝利によって幕を下ろそうとしていた。